Rの依存パッケージを一括で取得したい
初めに
この記事はRのアドベントカレンダーの17日目となります．
追記
自分の調査不足で記事が存在しておりました!!!
kyyonko.hatenablog.com 使いやすいし，ダウンロードまでしてくれるのでこちらを参考にしてください．
4月のお話（注意：事実とは異なる部分が含まれてます）
???「入社おめでとうございます．弊社はセキュリティーが厳しいので外部ネットワークに接続されてません．ですので，PythonやRのパッケージは申請してOKが出たらローカルの環境に入れることができます．」
私（...?!学生の頃より厳しい...?!）
起きたこと
私「glmnet 動かしたいからお伺いをたてるぞ」 私「その前に，一応document読んどくか」 私「ふむふむ，これ，glmnet以外にいくつかパッケージ必要じゃね？」 私「しかも，そのパッケージにまた必要なパッケージあるやん」 私「まあ，そんなに個数ないから目で調べてやるか」 私「あれ？調べて，お伺いをたてたら一日たったぞ？？？」 次の日 ???「ローカルにパッケージ入れていいよー」 私「これで動かせるぜ」 コンソール「install.package」 私「いい感じに動いたな」
翌月．．．
私「よーし，Rstan動かしたいからまたお伺いたてるぞ」 私「今回は前回より多いな」 私「まーいけるやろ」 私「また依存関係調べてたら一日が過ぎてしまった．」 次の日 ???「ローカルにパッケージ入れていいよー」 私「これで動かせるぜ」 コンソール「install.package」 R「足りないから動かないよ」 私「．．．うそん」
（注意：事実とは異なる部分が含まれてます）
やったこと
このような悲劇を二度と起こさないためにも， 一つのパッケージが依存しているパッケージを見つけ出したい！！
Rの関数に依存パッケージを表示してくれる関数tools::package_dependencies()があります．
今回はtidyverseを例にします．
> tools::package_dependencies("tidyverse")
$tidyverse
[1] "broom" "cli" "crayon" "dbplyr"
[5] "dplyr" "dtplyr" "forcats" "googledrive"
[9] "googlesheets4" "ggplot2" "haven" "hms"
[13] "httr" "jsonlite" "lubridate" "magrittr"
[17] "modelr" "pillar" "purrr" "readr"
[21] "readxl" "reprex" "rlang" "rstudioapi"
[25] "rvest" "stringr" "tibble" "tidyr"
[29] "xml2"
これらがtidyverseをインポートするときに必要となるパッケージとなります． さらに，これらが依存するパッケージを知りたいので次のような処理を行います．
> dependent_package <- tools::package_dependencies("tidyverse")[[1]]
> i <- 0
> while( i <= length(dependent_package) ){
i = i + 1
pack <- dependent_package[i]
dependent_package <- unique(c(dependent_package,
tools::package_dependencies(pack)[[1]]))
}
>
> dependent_package
[1] "broom" "cli" "crayon" "dbplyr"
[5] "dplyr" "dtplyr" "forcats" "googledrive"
[9] "googlesheets4" "ggplot2" "haven" "hms"
[13] "httr" "jsonlite" "lubridate" "magrittr"
[17] "modelr" "pillar" "purrr" "readr"
[21] "readxl" "reprex" "rlang" "rstudioapi"
[25] "rvest" "stringr" "tibble" "tidyr"
[29] "xml2" "backports" "ellipsis" "generics"
[33] "glue" "methods" "utils" "grDevices"
[37] "assertthat" "blob" "DBI" "lifecycle"
[41] "R6" "tidyselect" "vctrs" "withr"
[45] "data.table" "gargle" "uuid" "cellranger"
[49] "curl" "ids" "rematch2" "digest"
[53] "grid" "gtable" "isoband" "MASS"
[57] "mgcv" "scales" "stats" "cpp11"
[61] "pkgconfig" "mime" "openssl" "fansi"
[65] "utf8" "clipr" "vroom" "tzdb"
[69] "Rcpp" "progress" "callr" "fs"
[73] "knitr" "rmarkdown" "selectr" "stringi"
[77] "tools" "graphics" "rappdirs" "rematch"
[81] "nlme" "Matrix" "splines" "farver"
[85] "labeling" "munsell" "RColorBrewer" "viridisLite"
[89] "askpass" "bit64" "prettyunits" "processx"
[93] "evaluate" "highr" "yaml" "xfun"
[97] "htmltools" "tinytex" "jquerylib" "lattice"
[101] "colorspace" "sys" "bit" "ps"
[105] "base64enc" "fastmap"
(注意：ちょっと時間かかります．)
いい感じに依存パッケージを抽出できました！ これで，いらない仕事をやらなくて済みます！
まとめ
いつか使う誰かのために．．．
